Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk8Q8R3L8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms