Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms