Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms