Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms