Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

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Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snrnp27Q8K194 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Snrnp27Q8K194 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Snrnp27Q8K194 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Snrnp27Q8K194 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Snrnp27Q8K194 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Snrnp27Q8K194 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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