Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Znf628Q8CJ78 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Znf628Q8CJ78 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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