Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms