Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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