Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cacnb2Q8CC27 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cacnb2Q8CC27 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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