Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hdac7Q8C2B3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hdac7Q8C2B3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hdac7Q8C2B3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hdac7Q8C2B3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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