Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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