Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fam53cQ8BXQ8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fam53cQ8BXQ8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fam53cQ8BXQ8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fam53cQ8BXQ8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fam53cQ8BXQ8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fam53cQ8BXQ8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam53cQ8BXQ8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fam53cQ8BXQ8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fam53cQ8BXQ8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam53cQ8BXQ8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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