Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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