Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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