Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmco3Q8BH01 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms