Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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