Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms