Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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