Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jmjd4Q8BFT6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms