Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms