Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR4

Znf598, E3 ubiquitin-protein ligase ZNF598, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf598Q80YR4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Znf598Q80YR4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Znf598Q80YR4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Znf598Q80YR4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Znf598Q80YR4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf598Q80YR4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf598Q80YR4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms