Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ClmQ7TSN2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ClmQ7TSN2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ClmQ7TSN2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ClmQ7TSN2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ClmQ7TSN2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ClmQ7TSN2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ClmQ7TSN2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ClmQ7TSN2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ClmQ7TSN2 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ClmQ7TSN2 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms