Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ckap2lQ7TS74 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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