Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms