Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms