Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms