Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Topbp1Q6ZQF0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms