Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms