Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms