Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trak1Q6PD31 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms