Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rftn1Q6A0D4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms