Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Pdzrn3Q69ZS0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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