Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms