Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ss18Q62280 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ss18Q62280 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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