Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms