Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbm38Q62176 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms