Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga6Q61739 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga6Q61739 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms