Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1aQ61495 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms