Protein–RNA interactions for Protein: Q61481

Pde1a, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1aQ61481 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pde1aQ61481 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pde1aQ61481 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pde1aQ61481 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pde1aQ61481 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pde1aQ61481 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pde1aQ61481 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pde1aQ61481 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pde1aQ61481 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pde1aQ61481 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pde1aQ61481 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1aQ61481 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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