Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne1Q61457 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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