Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms