Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctf1Q60753 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctf1Q60753 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctf1Q60753 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctf1Q60753 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctf1Q60753 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctf1Q60753 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctf1Q60753 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctf1Q60753 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctf1Q60753 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms