Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcf4Q60722 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms