Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms