Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxd4Q60688 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms