Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim38Q5SZ99 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Trim38Q5SZ99 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trim38Q5SZ99 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms