Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXG7

Vmo1, Vitelline membrane outer layer protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmo1Q5SXG7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmo1Q5SXG7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmo1Q5SXG7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms