Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr1Q5SWD9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms