Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme4Q5SSW2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms