Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms